При определении налоговой базы по налогу на прибыль организаций не учитывайте полученные и использованные по назначению учреждением субсидии на выполнение государственного (муниципального) задания, ведь они относятся к средствам целевого финансирования. При этом вы обязаны вести раздельный учет доходов (расходов), полученных в рамках субсидий на выполнение государственного (муниципального) задания, иначе они будут рассматриваться как подлежащие налогообложению с даты их получения.
Основание — пп. 14 п. 1 ст. 251, п. 1 ст. 252, п. 49 ст. 270 НК РФ, Письма Минфина России от 30.04.2021 N 03-03-06/3/33900, от 12.12.2019 N 03-03-06/3/97089.
Кроме того, выполнение работ (оказание услуг) бюджетными (автономными) учреждениями в рамках государственного (муниципального) задания, источником финансового обеспечения которого является субсидия из соответствующего бюджета бюджетной системы РФ, НДС не облагается (пп. 4.1 п. 2 ст. 146 НК РФ, Письма Минфина России от 27.06.2013 N 03-07-07/24502, от 08.05.2014 N 02-02-09/21987).
Более подробно с данным материалом Вы можете ознакомиться в СПС КонсультантПлюс